最常見的牙病，是由蛀牙引致的牙髓炎所引發的，適當的治療方法是補牙或根管治療。可是引致智慧齒痛的主因，則有所不同。由於智慧齒往往是阻生(即不能整顆牙齒長出來)的，因此容易使食物渣滓積聚於牙肉裡面，再引致發炎，而最適當的治療則是將智慧牙齒脫除。

沒有發炎的阻生智慧齒亦有可能產生不同的問題，例如它能促使相鄰的第二顆大牙被蛀蝕、引致水囊(Cyst)或腫瘤(Tumour)，阻生智慧齒引致的水囊叫Dentigerous Cyst。同樣位置如有水囊或腫瘤，除了可能是Dentigerous Cyst之外，有可能是較為嚴重的其他水囊或腫瘤，例如「牙源性角化水囊」(Keratocyst) 或良性的「造釉細胞瘤」(Amcloblastoma)。